Após a sua criação em 1997, o FEMA operou através de esforços voluntários dos membros e da Direcção Executiva.
O FEMA nunca teve os recursos financeiros para formar uma instituição eficaz e, por conseguinte, carecia da capacidade institucional, técnica e de recursos Financeiros para cumprir o seu mandato eficazmente. Em 2001, a USAID concedeu fundos ao FEMA por um período de três anos, para financiar:
O objectivo geral do apoio da USAID ao FEMA consistiu em institucionalizar o FEMA de forma a que este pudesse desenvolver programas ambientais para benefício dos seus membros e participar efectivamente num Diálogo Político com o Governo. O apoio ao Sector Privado aumentou o nível de sensibilização e a capacidade técnica dos gestores do sector industrial relativamente a tomada de decisões sólidas sobre a gestão ambiental. Quando o quadro de pessoal ficou completo, o FEMA desenvolveu e implementou várias iniciativas visando aumentar o nível de consciencia ambiental, o conhecimento e iniciativas da indústria e do sector empresarial.
O FEMA também recebeu em 2000 apoio do Fundo das Nações Unidas para o Desenvolvimento Industrial (UNIDO) com o propósito de criar um Centro de Produção Mais Limpa. Esta iniciativa serviu para transferir tecnologia de valor para os membros do FEMA ao nível das fábricas, mas não abordou a capacidade do FEMA de desempenhar o seu mandato mais geral com vista a iniciar um diálogo e influenciar as políticas ambientais que afectam os diferentes sectores nos quais os membros do FEMA operam.